如從前地鐵綫較遠之車站出發前往紅磡站，會被收取最高港幣3.5元（單程票）／2.9元（八達通）之差價。 而大堂同時亦設有香港郵政郵箱[22][23]、港鐵「會員服務站」[24]、自動櫃員機以及自動售賣機等。 現今紅磡站的建立，屬九廣鐵路－英段[註 2]現代化工程的一個重要部分，該工程主要包括全線鋪設雙軌以及列車電氣化，兩項工程的起點均由紅磡站開始。 死者兒子指出港鐵至今僅稱正配合警方調查，完全未正面交代當時尋找父親的情况，相信如港鐵能夠及時查找，會有更大機會救回父親，質疑港鐵有心隱瞞。 他又質疑路祭當天有約10名職員包圍涉事的傷殘洗手間，不容許家屬靠近，並形容港鐵好像害怕被人知道及拍攝。
而前九鐵於1997年利用原货场地块扩建，增建交通、商业设施并新建屋顶，新大堂由建築師霍朗明设计。 大堂主体结构位于3层，並设有C出口大堂、直通车出／入境大堂以及其票务與服务中心，更设有入境事務處設施辦理旅客往返內地的出入境手續；而2層为转换交通层[18]，該層並设有A－B、D出口[19]。 要時租嘅請去九龍站或奧運站；註2：只接受八達通付款；註3：出入停車場之間，同一張八達通不可使用超過9次。
紅磡火車站停車場: 泊車轉乘計劃
兩鐵合併後，港鐵為東鐵綫各車站月台進行較低成本的翻新工程，以遮掩車站月台殘舊的觀感。 工程包括重新為車站配主題色，並加入花的代表，為月台橫樑及支柱翻上月台配色的油漆，貼上印有車站主題花圖案、附近／主題建築物／街道及站名書法字的牆紙，且加設港鐵化路線圖、指示牌、告示等標識系統，將現有指示牌及直立站牌統一為原地鐵格式。 而紅磡站被配色為 紅色，主題花為洋紫荊，而街景則為紅磡站城際直通車／C出口大堂及香港體育館。 九鐵曾於1993年於車站中層興建2個大堂，以及於1－4號月台盡頭興建一個以粉紅色為色系、連接月台及中層的大堂與E出口，方便乘客前往尖東海濱長廊；同時亦將調車台軌道縮短至僅於5－7號月台使用。 紅磡火車站停車場 不過為配合尖沙咀支線工程，位於1－4號月台盡頭的大堂及E出口已於2001年2月1日起永久封閉及拆卸。 此站雖以紅磡為名，實際上車站是座落於紅磡灣西岸，與傳統上的紅磡區相差約1公里[1]。
- 在新九龍車站啟用當日，尖沙咀至何文田的一段路軌亦停用並拆卸，而尖沙咀的舊九龍車站亦於1978年拆卸，但仍保留尖沙咀鐘樓作為法定古蹟。
- 另外，港鐵亦在2016年興建沙中綫期間在車站C出口大堂外設置多間站外商店，其中包括便利店、麵包餅店、點心蒸飯店等。
- 而紅磡站被配色為 紅色，主題花為洋紫荊，而街景則為紅磡站城際直通車／C出口大堂及香港體育館。
- 1990年代中期，車站平台向紅磡灣方向進行擴建，原位於平台上的巴士總站遷移至現址，新平台上亦新建由英國建築師霍朗明团队下属的Foster Asia設計的新大堂取代舊大堂，奧雅納则协助完成了交通流量预测及规划，擴建工程於1997年完成。
原本沙中綫的東西走廊（現稱屯馬綫）可望於2019年通車，但鑑於沙中綫偷工減料醜聞，而最壞情況甚至會拆毀原本快完工的月台重建，最終只能分段通車。 唯政府及港鐵後來指車站新月台結構安全不用清拆，僅會用不同方式為月台進行加固工程，相關工程已於2021年1月完成，屯馬綫縱而踏入試營運階段。 紅磡火車站停車場 自2021年2月16日起，屯馬綫一期部分列車在抵達啟德站後，會先確保所有乘客已下車，然後列車將繼續駛往紅磡站，再在紅磡站折返，中途停靠沿途各站，以進行路段測試。
紅磡火車站停車場: 紅磡火車站停車場高度
而於2012年動工的沙田至中環綫工程将构建香港铁路的「東西走廊」（現屯馬綫）與「南北走廊」（現東鐵綫過海段），而紅磡站則成為两条走廊的轉車站[9]。 工程计划利用位於红磡站东侧的紅磡貨場：包括停用紅磡貨場及配套國際郵件中心與紅磡貨運碼頭，其设施則改建为屯馬綫列車停放處，并于該位置興建兩層新月台[10]。 原有的九廣鐵路南端終點站位於尖沙咀，但該車站使用逾半世紀後，未能滿足日益增加的運載需要，加上車站附近已有一定的發展，當時的英屬香港政府須另覓土地以興建新的鐵路終點站。 最終政府決定在海底隧道旁的填海地上，斥資約1.5億港元興建一座新車站[7]，也就是現在的紅磡站，同時在車站旁興建紅磡貨場。
2022年5月14日，自1975年啟用的舊月台最後一日運作，有不少市民及鐵路迷於該日晚上拍照紀錄。 紅磡火車站停車場 而當日尾班車在深夜約12時28分由紅磡站開出，列車離開車站期間有大批鐵路迷揮手道別[51]。 而直通車方面，中方一直以九龍站稱呼紅磡站，直至2019年4月才改名為香港紅磡站，與廣深港高速鐵路香港段的終點站香港西九龍站（西九龍站）一致。
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不過車站通往尖東、理工大學、紅磡海底隧道來回方向巴士站的A、D出口仍須關閉[72][73][74]。 負責層板混凝土工程的分判商中科興業有限公司在同年6月1日發新聞稿，證實其前線人員曾最少兩次向總承建商禮頓通報造假情況，但與承建商禮頓簽有保密協議，故不能披露工程內容[55]。 涉事工程的總承建商禮頓建築將工程的紮鐵工序外判予2間分判商，惟當中的泛迅建築有限公司，在參與工程一年後才註冊為公司[56]。 紅磡火車站停車場 直到同月6日，港鐵首度公開被剪短鋼筋的照片，並表示5次巡查當中，4次均沒有書面紀錄，均未有向董事局或政府匯報。
九廣鐵路曾在1910年啟用初期[32]，於現今理工大學鍾士元樓A座及香港歷史博物館之間，設置以木材興建的臨時車站。 但該站於1921年9月15日[註 4]停用及被拆卸，惟周邊土地仍有作為鐵路用途。 紅磡火車站停車場 現時位於紅磡站車站大堂外設有紅磡站公共运输交汇处（巴士站、小巴站、的士站），內有多條巴士、小巴路線或的士往返各區。 另外，港鐵亦在2016年興建沙中綫期間在車站C出口大堂外設置多間站外商店，其中包括便利店、麵包餅店、點心蒸飯店等。 紅磡火車站停車場2025 紅磡站大堂的主体结构建于1976年，並由當時的工務司署負責設計。 當時的車站大堂頂部曾裝設多個獨特的球型照明燈光（俗稱「波波燈」），不過在1990年代中期進行改建時被假天花取代。
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另外，車站亦鄰近多個重要地標、住宅區及酒店等，在觀塘綫未延伸至黃埔花園一帶時，有不少居民更步行或乘搭巴士、小巴前往紅磡站轉乘鐵路，因此每日均有不少乘客進出紅磡站。 紅磡火車站停車場2025 而每當鄰近的香港體育館有活動進行（如演唱會、國際體育賽事等），車站更會出現大量的人流。 另外，往返中國內地的城際客運服務（直通車）於1979年重新投入服務，城際客運服務列車在香港的終點站亦設於紅磡站，而城際客運服務一直延續至今，並遍及內地多個城市，包括廣州、上海、北京等地。 同年8月11日，港鐵召開2022年中期業績公佈會，期間行政總裁金澤培亦提及對該男子在紅磡站死亡事件深感婉惜，並向事主家人致以深切慰問[83]；而港鐵香港客運服務總監楊美珍表示，港鐵對有關事件非常重視，並已經展開詳細內部調查。
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2004年10月24日，尖沙咀支線通車，九廣東鐵南行列車改以尖東站為終點站。 此後直至九龍南綫通車前，九廣東鐵列車只會使用紅磡站2、3號月台，而4號月台則作為停放待避列車或以紅磡站為終點站之用；而1號月台的編號及路軌更曾一度被停止使用。 1973年，九廣鐵路開始電氣化工程，同時也一同將九廣鐵路由尖沙咀縮短至紅磡，新車站於1975年11月30日啟用。
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2018年5月30日，香港《蘋果日報》報道紅磡站地底新建月台的兩幅主要牆身，近兩成螺絲頭破損或移位，不能與月台層的鋼筋接駁扭緊，而負責承建商禮頓建築不但未有更換問題部件，反偽裝成功接駁，安排工人將鋼筋剪短。 紅磡火車站停車場 工程師指有關做法讓鋼筋拉力大減，影響結構承重能力，最嚴重可導致全層倒塌。 紅磡火車站停車場 而位於下層的南北走廊（即東鐵綫）月台層板搭建後，連續牆的接駁位在2016年6月被拍攝的相片顯示多處出現滲水。 而港鐵一度否認牆身滲水，直到媒體公開滲水的影片及相片後，港鐵才改口承認[52]。
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而目前因受2019冠狀病毒病疫情的影響，城際鐵路列車已於2020年1月30日起暫停運行，直到2022年4月末有消息指城際直通車有機会永久停运[31]。 該藝術品由三組作品組成，其中兩組位於屯馬綫月台；一組大型裝置計劃設置於大堂。 作品以不同年代及種類的行李及物件創作雕塑及玻璃圖案，以展現站內乘客的不同失物，包括鑰匙、錢包、帽子以及鞋等。 藝術家指藝術品經歷7年才完成，並透露曾經因社會經歷不少事件，曾想過放棄繼續創作[27]。 目前紅磡站共設有4層，其中C／U2／3層為C出口／城際直通車大堂，同時設有升降機以及扶手電梯通往位於U3層的餐廳；U1／2層為A－B、D出口大堂／隧道；而P層為城際直通車月台層及東鐵綫列車停放側綫[註 3]；至於G層為屯馬綫月台；而L1層則為東鐵綫月台。
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由於工程在現有大堂之下興建，不能超過7米的高度限制，故須採用特製建築機器施工[39]。 紅磡站前稱為九龍車站，後來才易名為紅磡車站，至於其原因有個講法，就是為了避免與東涌綫以及機場快綫的九龍站混淆，但是早於1994年，鐵路發展策略及東鐵尖沙咀支線公佈時，就已經建議將九廣鐵路（英段）由原來位於紅磡的九龍車站延伸至尖沙咀，並正式將九龍車站更名為紅磡車站。 初時稱作九龍紅磡站，直到1996年2－3月[註 6]，九龍車站正式易名為紅磡車站，並為九廣鐵路（英段）亦改名為九廣東鐵。 雖然紅磡站鄰近尖沙咀站與佐敦站，同時亦屬於油尖旺區，但票價卻存有顯著差異，亦有短程票價比長程昂貴之情況出現。