该基因解码技术为破解人类基因组密码提供了“神器”。 池天2025 7月22日,池天团队在《细胞》在线发表论文,报道了一种崭新的小鼠基因打靶技术iMAP,并快速鉴定了90个基因在39种组织的基本功能,构建了世界首张小鼠微型“扰动图谱”。 该基因解码技术为破解人类基因组密码提供了强大武器。 利用固态核磁为主要手段,开发新的核磁技术,研究生命体中重要的功能蛋白的结构和机制。 IMAP融合了Cre-loxP和CRISPR-Cas9技术,其核心组成部分是一个转基因序列,它由U6启动子和下游一串gRNA表达单位构成。
虽然多款上市的CAR-T药物在血液肿瘤中展现出显著的疗效,但其在治疗实体瘤方面一直疗效不佳,其中一个重要原因是CAR-T 细胞容易功能耗竭。 如何解决功能耗竭这一难题是实体肿瘤CAR-T治疗中的热点与难点。 近期研究发现,多数实体肿瘤CAR受体在无肿瘤抗原刺激时,仍然会产生一种持续的基底信号(tonic 池天 signal),而这种基底信号,会持续刺激CAR-T细胞,导致CAR-T细胞功能耗竭。 同时,近期临床研究也表明,基底信号的过度不足也会影响CAR-T细胞的持续和疗效。 因此,了解基底信号形成和维持的机制可以帮助设计高持续、抗耗竭的CAR-T细胞,提高CAR-T疗效。
池天: 课题组简介
IMAP研发过程是“山高路远坑深”,但审稿过程相当顺利。 今年2月15日投稿,3月10日得到反馈,月底补完实验,5月12日论文就被“原则上接收”,6月21日被正式接收。 神经元在特定时间、特定位置、与特定靶标之间形成正确连接,是神经系统能够正确发挥功能的解剖学基础。 我们以秀丽线虫为模式生物,结合哺乳动物细胞系,研究神经元与其靶标之间的连接在发育时如何形成,在衰老时如何退行,以及在损伤后如何修复的机制。 池天2025 主要实验室地点为上海科技大学林照博课题组。 依照瓯江实验室标准发放工资,享受浙江省/温州市相关人才政策,依照经验调整待遇。
- 最后,iMAP与单细胞组学技术相容,从而可用于描绘单细胞扰动图谱。
- 虽然多款上市的CAR-T药物在血液肿瘤中展现出显著的疗效,但其在治疗实体瘤方面一直疗效不佳,其中一个重要原因是CAR-T 细胞容易功能耗竭。
- 5、学院院务会议及学术委员会秘书;
- 不过,用传统基因解码方法无法快速有效地描绘扰动图谱。
- 目前,单细胞生物学的领军人物Aviv Regev已与池天酝酿发起“单细胞扰动图谱计划”。
为清晰展示丰度的下降,本图的color scheme将丰度上升当成丰度不变。 池天 人类CEG的同源基因(粉红色)富集于Cluster IV-V, 提示这些基因一般也为小鼠多种乃至全部组织所必需。 转基因通常只表达第一个sgRNA,而利用他莫昔芬激活Cre,可使转基因发生重组,其余的sgRNA从而得以全部表达,但每个细胞只随机表达其中一个(图1B)。 这些sgRNA可在Cas9的帮助下敲除相应的靶基因,从而将小鼠转化为嵌合体(图1C)。 池天课题组开发的 iMAP技术具有病毒文库的优点(高通量、嵌合型扰动),却无其短板(sgRNA遍布全身,小鼠品系能重复使用),从而使原位筛选变得简单易行,更使扰动图谱变得可望而可及。 这种新型动物可用于鉴定100个靶基因在全身各种细胞中的功能,同时也能通过简单的配繁衍生出100个传统的单基因敲除品系以用于后续验证等实验。
池天: 课题组成员及合影
“这一图谱将成为生物医学研究史上的一个重要里程碑——此后,探索小鼠任何基因的基本功能会像查找基因序列一样简单,而不再动辄需花费多年心血。 整个生命过程并非只由我们体内的基因和蛋白来决定,而也一直受到环境因素的积极调控。 我们主要关注在生命生长发育过程中起到关键作用的外界因素,包括脂肪酸等常见的营养分子,以及我们的共生菌。 我们想深入了解这些因子对生命过程起到的无可替代的作用,以及利用这些天然因子来帮助我们健康成长及对抗病原菌。 作为一家立足于生命科学领域,有自主知识产权的国家高新技术企业,康为世纪生物科技股份有限公司主要从事高附加值、高技术含量的生物试剂的研发与生产,为生命科学研究、基因检测和体外诊断用户提供创新型生物产品和服务。
因此,我们的实验室专注于优化调节T细胞抗肿瘤功能的传感元件和转导元件以及效应元件。 ”为使同行避免重蹈覆辙,这些失败的实验,部分已于两年前以预印本形式发表。 经Ravinder Kaundal (耶鲁大学博士后)和陈玉鑫、毛少帅、刘波(分别是上科大生命学院2014、2015、2016级研究生)等的努力,到2018级博士生荆征宇加入课题组时,终于曙光初照,但道路依然坎坷。 “我们的研究工作很少有可以参考的文献,研究期间我们遇到了各种困难,好在最后成功了。
池天: 上海科技大学2018年拟录取硕士研究生名单公示(不含推免生)
作为人体免疫系统的重要组成部分,T细胞在对肿瘤细胞的免疫监控和杀伤中起着至关重要的作用。 但是,肿瘤细胞能够利用多种方法来抑制T细胞的抗肿瘤活性,从而逃避机体免疫系统的攻击。 因此在临床上,可以通过提高T细胞的活性来治疗肿瘤。 目前,基于T细胞的肿瘤免疫疗法已经在临床上取得令人瞩目的成功,具有广泛的应用前景。 但是现有的治疗方法只对一部分的肿瘤病人有效,并且还有着相当程度的副作用。 因此,进一步研究T细胞激活的调控机理,将有助于开发新的肿瘤免疫治疗方法以改善疗效,并让更多的病人受益。
本实验室在美国化学会志杂志上与南京大学合作发表了一篇关于一类具有特殊催化能力的多肽分子的结构和催化机制的研究文章。 TDP-43蛋白的错误折叠和人肌萎缩侧索硬化症,额颞叶变性运动神经元疾病相关。 池天 本实验室利用固态核磁研究了TDP-43C端蛋白的错误折叠机制,工作在权威化学期刊美国化学会志杂志上发表。 池天2025 在当前的研究中,我们结合代谢、免疫、生化技术方法与分析手段,且应用细胞和小鼠模型,以代谢为切入点,旨在阐明炎症反应调节的基本原理与机制。
池天: 孙博, PhD副教授 研究员 博士生导师
要阐明小鼠基因功能,需要将其在小鼠敲除(扰动),观察其结果。 长期以来,我们对小鼠基因功能的研究处于低通量的水平,每次只能敲除、表征一个基因。 而小鼠体内编码蛋白的基因有2万个,可以想象基因研究花费的时间之长、费用之高、速度之慢。 接下来,李名友、桂朗团队还将结合干细胞培养和诱导技术、基因编辑技术和细胞移植技术等多种研究手段,建立繁殖困难、繁殖周期长、珍稀或濒危鱼类生殖干细胞体系,开展生殖干细胞基因编辑介导的养殖鱼类优良种质创制新技术。 李名友和桂朗团队在前辈的研究成果上,将模式鱼干细胞培养技术应用于马口鱼及刀鲚中,在全球首次建立体外长期培养的养殖鱼——马口鱼精原干细胞系。 从一个个又小又圆的马口鱼精原干细胞,到在实验皿内能够发育出鞭毛自由摆动的精子,长期培养的经济鱼类的生殖干细胞在培养基中完成了发育成精子的神奇之旅,属全球首次。
池天: 洪诗雅, PhD教授 研究员 博士生导师
该论文使用单分子光镊技术揭示Cas9蛋白与靶向DNA之间相互作用的重要结合位点,并阐明这些位点在该蛋白与DNA结合、解离等过程中的重要调控作用。 该工作为进一步优化Cas9活性、减少脱靶提供了重要的分子基础及新思路。 池天2025 研究团队首先构建了一个iMAP品系,它携带61个gRNA 表达单位,共靶向6个功能已知的标志基因。 利用这种嵌合体,可同时鉴定多个基因分别在多种细胞里的功能,也可衍生出多种传统的单基因敲除品系用于后续实验(图1)。 目前,单细胞生物学的领军人物Aviv Regev已与池天酝酿发起“单细胞扰动图谱计划”。
池天: 陆珺霞, PhD助理教授 研究员 博士生导师
学院自2013年依托中国科学院大学招收第一届硕士研究生,2017年开始独立招收研究生。 2021年10月,上科大获批增列生物学博士学位点。 截至2023年3月,已招收硕士研究生2018名,其中788名通过转博资格考核转为博士研究生,招收直博研究生6名,外招博士40名。 已毕业硕士研究生356名,博士研究生303名。 毕业生全部在国内外一流高校继续深造或在医药行业从业。 P型ATP酶转运体家族P5各成员在神经发育中的作用机制研究:神经元及其连接的发生需要通过神经元细胞膜上受体来接受胞外信号分子的指导。
池天: 邹燕, PhD助理教授 研究员 博士生导师
大小限遇陀罗星利于探讨人生,事业宜守火星:代表有胆识,外向,不耐静。 「主星」14颗:紫微:代表官贵,事业宫为得位。 廉贞:代表争夺,事业宫为得位,大小限遇廉贞星有突发之幸运及桃花运太阳:代表博爱,事业宫为得位。 大小限遇武曲星有财禄之时机天府:代表现实,财帛宫为得位。 大小限遇天府星想当老板有意外之财运天同:代表享受,福德宫为得位。
池天: 池天研究内容
“21世纪生物医学的重要任务是解码人类基因组这部神秘天书。 ”池天教授表示,iMAP诞生的背后是一场长达八年、历经六届学生前赴后继努力的科学“马拉松”,研发过程充满了艰辛和曲折。 研究团队首先构建了一个iMAP品系,它携带61个gRNA表达单位,共靶向6个功能已知的标志基因。
池天: 王皞鹏, PhD副教授 研究员 博士生导师
但是Atls是如何被调控来保持内质网动态稳定,以及内质网形态异常和痉挛性截瘫之间存在的关联性都不清楚。 我们发现定位于内质网膜上的泛素连接酶Hrd1通过泛素化修饰Atls,帮助维持内质网形态的动态平衡 (iScience 2020)。 诚如其创始人王春香博士所说:IVD原料酶对于生物医药类企业来说,相当于电子产品的“芯片”。 为了打造出中国生命科学领域的“芯片”,像中国高铁一样,成为国人的骄傲和中国的名片,未来康为世纪将在完善分子检测原料相关核心技术的同时,持续开发行业前沿的分子检测技术,围绕消化道疾病和呼吸道传染病的检测,开发创新型的分子诊断产品和服务。 利用现有研发体系,通过补充必要先进设备、引入关键技术人才、充分利用产业链一体化的生产能力及技术资源,拓展公司在相关领域的自主创新能力和研发水平,保持公司技术和产品的先进性。
池天: 朱焕乎, PhD助理教授 研究员 博士生导师
天月:象征安分,为人与世无争,无主见。 池天2025 阴煞:象征疑心,为人易自我反省约束。 天姚:象征交际,为人多纵情,人缘佳。 解神:象征消灾,在有灾祸前,心灵感应强。 天官:象征官贵,为人较保守,喜爱享受。 天福:象征吉祥如意,乐于助人,喜爱享受。
池天: 学院概况
研究团队还进一步通过简单的配繁,从iMAP鼠衍生出多个传统的单基因敲除品系,证明了iMAP 的另一重要用途。 学校全面采用国际通行的常任教授制度(Tenure track system),截至2022年5月,生命学院已经拥有一支以79名常任教授为主体的教师队伍,其中正教授9名,副教授20名,助理教授50名。 常任教授90%以上具有海外一流高校博士或博士后经历,形成一支以青年优秀人才为主力、资深教授为核心的金字塔式学术人才梯队。 封面故事:孔子观欹器的典故孔子带着弟子们在鲁桓公的庙里参观,在那里看到一件被称作“欹”(音同戚,倾斜的意思)的器物。 孔子向他的学生介绍说,这是鲁桓公放在座位右边的歆器,用来警戒鲁桓公自己(座右铭的来源)。 “欹”器有三种状态:空的时候就会倾斜,水在不多不少的时候就端端正正地立着,水装满的时侯就会倾覆(中庸之道)。
池天: 代表论文
目前,单细胞生物学的领军人物Aviv Regev已与池天酝酿发起“单细胞扰动图谱计划”,准备在全球范围内联合多个实验室,利用iMAP在单细胞水平描绘小鼠全部2万个蛋白编码基因在全身各组织的扰动图谱。 非编码RNA对神经元发育和稳态的时空调控:神经连接作为神经元用来接收和传递信息的重要结构,其特异化的形态和结构对于突触传递、信息整合、神经环路形成及可塑性都至关重要。 神经连接的发育过程包括了一系列的连续事件,例如神经突的起始、往特定位置的延伸、在靶目标上形成突触等,这些事件触发、衔接和转承的时机都需要精确的调控。 池天2025 最近,我们还通过对双相情感障碍病人的测序发现,mir-27a基因上的一个SNP干扰它的成熟,使得其靶基因NCAM1的水平发生改变,从而影响神经元的迁移和递质释放 (Communications Biology 2022)。
池天: 池天 – 野町(天ぷら)
异位妊娠(ectopic pregnancy)是胚胎在子宫外著床的疾病,其中 95% 为输卵管妊娠。 严重时会造成输卵管破裂,甚至孕妇的生命危险。 由于异位妊娠缺乏小鼠模型,我们建立了人类子宫内膜、胎盘绒毛、输卵管上皮三种类器官(organoid)以研究其致病机制。 类器官为多能干细胞或成体干细胞在三维环境下形成的细胞团块,可以模拟或重现成体器官或组织的复杂细胞亚型及微环境。
池天: 罗振革, PhD教授 研究员 博士生导师
作为概念验证研究,池天课题组检查了90个基因敲除后分别对39种器官/组织/细胞 (后文统一称“组织”)丰度的影响, 描绘了世界第一张“扰动图谱”。 2.发现疾病新靶点,实现老药新用:很多疾病难以治疗, 原因是靶点不明,或者靶点已知但缺乏安全有效的药物。 拟利用iMAP,发现疾病靶点,同时探索老药靶点在疾病中的新作用,实现“老药新用”,从而跳出新药研发之漫长、昂贵、痛苦的历程。